解放军医学院学报

作者：陈诗雪, 赵磊, 崔月倩, 姬时宇, 胡毅

关键词：双特异性抗体, 杵臼结构, 分子动力学

目的 分析双特异性抗体杵臼结构(knobs-into-holes，KIH)的稳定性及异源重链二聚化的结合效率，为设计出更稳定的双特异性抗体奠定基础。 方法 采用分子动力学模拟和泊松玻尔兹曼面积(molecular mechanics-Poisson Boltzmann surface area，MM-PBSA)方法分析KIH结构的稳定性并计算结合自由能，将其与标准结构CH3野生型(wild-type，WT)进行对照比较，并通过SDS-PAGE和银染技术观察二者的结合效率。 结果 在355 K温度下CH3 WT均方根偏差(root-mean-square deviation，RMSD)涨落小于1.0 Å，CH3 KIH波幅超过2.0 Å，主要是由于KIH knob部分3-27、45-52、70-80位氨基酸缺乏稳定性。WT和KIH中重链结合自由能分别为79.864 9 kJ/mol、107.008 2 kJ/mol，KIH的结合自由能更高，不利于两重链的结合。进一步计算结合面氨基酸结合能，找到了KIH中对结合作用贡献较小的10个氨基酸残基。银染观察KIH异源重链正确结合效率不足80%，远低于WT。 结论 本研究发现双特异性抗体KIH结构的稳定性和重链结合效率均不如WT，并确定了KIH中缺乏稳定性和对结合作用贡献较小的氨基酸残基。

来源：2017年第12期

《解放军医学院学报》期刊编辑部

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