国内刊号:10-1117/R
国际刊号:2095-5227
发布日期:
作者:陈奇, 武惠韬, 孙金秀, 薛万国, 石金龙
关键词:胃癌, 转移, 分子标记, 差异基因
目的 利用生物信息学分析转移性胃癌和原位胃癌的在分子水平的差异,揭示转移性胃癌进展机制,为精准诊疗和预后评估提供潜在的分子靶点。 方法 从TCGA公共数据库获取胃癌患者RNA-Seq及DNA甲基化芯片数据,筛选转移性胃癌和原位胃癌在两个组学维度的一致性差异基因,评估其功能及富集通路并进行风险回归分析。 结果 筛选出一致性差异基因170个,转移组上调基因52个、下调基因118个。功能分析提示免疫调节、细胞分化、外源信号感应、自噬与溶酶体转运、药物及蛋白代谢等信号通路与转移性胃癌发生有关。针对上述基因进行预后风险评估,发现RTP3、GTF3C5、TMEM102、NHLRC3、FUT2、PGAP2、AAMP是与转移风险相关的7个关键基因,其联合表达信号可用于胃癌患者的预后评估。 结论 由7个关键基因组成的联合因子可为胃癌预后评估提供依据,是临床检测的潜在生物学标记物。
来源:2019年第8期
《解放军医学院学报》期刊编辑部