解放军医学院学报

国内刊号:10-1117/R

国际刊号:2095-5227

解放军医学院学报杂志2022年第10期:外伤性视网膜增殖膜转录组分析

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作者:靳瑛, 徐晓健, 陈慧瑾, 马志中

关键词:眼球开放伤, 增殖性玻璃体视网膜病变, RNA测序, 转录组, 信号通路

  背景  眼外伤是导致视力丧失的重要原因。外伤性增殖性玻璃体视网膜病变(proliferative vitreoretinopathy,PVR)是导致伤眼不良预后的重要原因,其发病机制尚不清楚。  目的  通过对开放性眼外伤后不同时期PVR增殖膜(视网膜前膜和视网膜下膜)转录组测序(RNA-sequencing,RNA-seq)分析,探究不同时期参与损伤修复过程的差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs)及信号通路的变化。  方法  本研究收集的北京大学第三医院眼科2015年1 - 12月4例男性(12 ~ 45岁)眼外伤患者标本,拟采用Bulk转录组测序技术检测开放性眼外伤后视网膜增殖膜的RNA表达,分析早期与晚期增殖膜内转录组差异基因的表达情况。  结果  通过京都基因和基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)分析,发现晚期增殖膜细胞外基质受体相互作用、细胞因子-细胞因子受体相互作用、细胞黏附分子、蛋白质的消化和吸收通路被激活,对应的上调基因有ITGA8、TNFRSF4、CLDN5、COL3A1。  结论  整合素β8亚单位有可能在PVR增殖膜RPE细胞的转分化过程中起到重要的作用。在血-眼屏障修复过程中,ATP1A2、SLC8A3和SLC7A15P基因起到了重要作用。

来源:2022年第10期

《解放军医学院学报》期刊编辑部

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